MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 3785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011982	AGGA	2	8	245340	245347	50 %	0 %	50 %	0 %	222080307
3502	NC_011982	GCCT	2	8	245470	245477	0 %	25 %	25 %	50 %	222080307
3503	NC_011982	CGA	2	6	245519	245524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080307
3504	NC_011982	CATC	2	8	245568	245575	25 %	25 %	0 %	50 %	222080307
3505	NC_011982	GGC	2	6	245633	245638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080307
3506	NC_011982	CGT	2	6	245667	245672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080307
3507	NC_011982	CGA	2	6	245738	245743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080307
3508	NC_011982	TGA	2	6	245777	245782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080307
3509	NC_011982	CCG	2	6	245896	245901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080307
3510	NC_011982	AAG	2	6	246058	246063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080308
3511	NC_011982	GC	3	6	246117	246122	0 %	0 %	50 %	50 %	222080308
3512	NC_011982	CGC	2	6	246155	246160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080308
3513	NC_011982	TG	3	6	246163	246168	0 %	50 %	50 %	0 %	222080308
3514	NC_011982	CGA	2	6	246173	246178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080308
3515	NC_011982	GGGT	2	8	246187	246194	0 %	25 %	75 %	0 %	222080308
3516	NC_011982	TCG	2	6	246202	246207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080308
3517	NC_011982	TCA	2	6	246230	246235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080308
3518	NC_011982	CGCAG	2	10	246238	246247	20 %	0 %	40 %	40 %	222080308
3519	NC_011982	CTTC	2	8	246356	246363	0 %	50 %	0 %	50 %	222080308
3520	NC_011982	CGTT	2	8	246509	246516	0 %	50 %	25 %	25 %	222080308
3521	NC_011982	GCC	2	6	246633	246638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080308
3522	NC_011982	GCGA	2	8	246676	246683	25 %	0 %	50 %	25 %	222080308
3523	NC_011982	GCC	2	6	246714	246719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080308
3524	NC_011982	CAC	2	6	246720	246725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080308
3525	NC_011982	AGG	2	6	246803	246808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080308
3526	NC_011982	CG	4	8	246980	246987	0 %	0 %	50 %	50 %	222080308
3527	NC_011982	GACCA	2	10	247000	247009	40 %	0 %	20 %	40 %	222080308
3528	NC_011982	CG	3	6	247022	247027	0 %	0 %	50 %	50 %	222080308
3529	NC_011982	CTG	2	6	247100	247105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080308
3530	NC_011982	GCC	3	9	247116	247124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080308
3531	NC_011982	TC	3	6	247138	247143	0 %	50 %	0 %	50 %	222080308
3532	NC_011982	TCAG	2	8	247270	247277	25 %	25 %	25 %	25 %	222080309
3533	NC_011982	CCGTG	2	10	247295	247304	0 %	20 %	40 %	40 %	222080309
3534	NC_011982	GGA	2	6	247334	247339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080309
3535	NC_011982	GCCG	2	8	247355	247362	0 %	0 %	50 %	50 %	222080309
3536	NC_011982	GCC	2	6	247366	247371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080309
3537	NC_011982	GAA	2	6	247386	247391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080309
3538	NC_011982	GGCG	2	8	247422	247429	0 %	0 %	75 %	25 %	222080309
3539	NC_011982	TCG	2	6	247432	247437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080309
3540	NC_011982	CG	3	6	247441	247446	0 %	0 %	50 %	50 %	222080309
3541	NC_011982	GAC	2	6	247531	247536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080309
3542	NC_011982	CTT	2	6	247638	247643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080309
3543	NC_011982	CGTC	2	8	247664	247671	0 %	25 %	25 %	50 %	222080309
3544	NC_011982	ATA	2	6	247806	247811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080309
3545	NC_011982	TCA	2	6	247840	247845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080309
3546	NC_011982	GAC	2	6	247901	247906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080309
3547	NC_011982	TGC	2	6	247949	247954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080309
3548	NC_011982	CACAG	2	10	247997	248006	40 %	0 %	20 %	40 %	222080309
3549	NC_011982	GGC	2	6	248022	248027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080309
3550	NC_011982	TGA	2	6	248048	248053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080309
3551	NC_011982	TCA	2	6	248071	248076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080309
3552	NC_011982	CGA	2	6	248246	248251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080310
3553	NC_011982	CCG	2	6	248355	248360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080310
3554	NC_011982	GTT	2	6	248478	248483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080310
3555	NC_011982	GAT	2	6	248565	248570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080310
3556	NC_011982	GAC	2	6	248580	248585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080310
3557	NC_011982	CAG	2	6	248655	248660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080310
3558	NC_011982	AGTG	2	8	248742	248749	25 %	25 %	50 %	0 %	222080310
3559	NC_011982	ACG	2	6	248800	248805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080310
3560	NC_011982	GC	3	6	248902	248907	0 %	0 %	50 %	50 %	222080310
3561	NC_011982	GTT	2	6	248944	248949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080310
3562	NC_011982	TGT	2	6	248988	248993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080310
3563	NC_011982	TTG	2	6	249105	249110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080310
3564	NC_011982	CCT	2	6	249137	249142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080310
3565	NC_011982	TGTTT	2	10	249226	249235	0 %	80 %	20 %	0 %	222080310
3566	NC_011982	CTG	3	9	249261	249269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080310
3567	NC_011982	ATA	2	6	249280	249285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080310
3568	NC_011982	TGATC	2	10	249305	249314	20 %	40 %	20 %	20 %	222080310
3569	NC_011982	TCCC	2	8	249361	249368	0 %	25 %	0 %	75 %	222080310
3570	NC_011982	AGA	2	6	249398	249403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080310
3571	NC_011982	AAGG	2	8	249411	249418	50 %	0 %	50 %	0 %	222080310
3572	NC_011982	ACG	3	9	249436	249444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080310
3573	NC_011982	CCG	2	6	249462	249467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080310
3574	NC_011982	GC	3	6	249494	249499	0 %	0 %	50 %	50 %	222080310
3575	NC_011982	CGC	2	6	249544	249549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080311
3576	NC_011982	GC	3	6	249560	249565	0 %	0 %	50 %	50 %	222080311
3577	NC_011982	TCG	2	6	249566	249571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080311
3578	NC_011982	GC	3	6	249633	249638	0 %	0 %	50 %	50 %	222080311
3579	NC_011982	ATGAT	2	10	249656	249665	40 %	40 %	20 %	0 %	222080311
3580	NC_011982	GAC	2	6	249681	249686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080311
3581	NC_011982	TCT	2	6	249704	249709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080311
3582	NC_011982	GAC	2	6	249717	249722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080311
3583	NC_011982	GCC	2	6	249745	249750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080311
3584	NC_011982	GGC	2	6	249827	249832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080311
3585	NC_011982	CGC	2	6	249858	249863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080311
3586	NC_011982	GCG	2	6	249881	249886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080311
3587	NC_011982	TCGA	2	8	249913	249920	25 %	25 %	25 %	25 %	222080311
3588	NC_011982	GGA	2	6	249935	249940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080311
3589	NC_011982	GGC	2	6	249954	249959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080311
3590	NC_011982	TCA	2	6	250010	250015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080311
3591	NC_011982	TGT	2	6	250044	250049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080312
3592	NC_011982	CGAT	2	8	250080	250087	25 %	25 %	25 %	25 %	222080312
3593	NC_011982	CCA	2	6	250099	250104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080312
3594	NC_011982	GAC	2	6	250154	250159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080312
3595	NC_011982	GCC	2	6	250243	250248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080312
3596	NC_011982	GCT	2	6	250285	250290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080312
3597	NC_011982	CCG	2	6	250291	250296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080312
3598	NC_011982	CG	3	6	250332	250337	0 %	0 %	50 %	50 %	222080312
3599	NC_011982	AT	3	6	250395	250400	50 %	50 %	0 %	0 %	222080312
3600	NC_011982	GATAT	2	10	250424	250433	40 %	40 %	20 %	0 %	222080312
3601	NC_011982	CCG	2	6	250436	250441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080312
3602	NC_011982	CAC	2	6	250451	250456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080312
3603	NC_011982	GATG	2	8	250498	250505	25 %	25 %	50 %	0 %	222080312
3604	NC_011982	CGC	2	6	250588	250593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080312
3605	NC_011982	GAC	2	6	250631	250636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080312
3606	NC_011982	TCT	2	6	250847	250852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080312
3607	NC_011982	ATTC	2	8	250862	250869	25 %	50 %	0 %	25 %	222080312
3608	NC_011982	CAGTC	2	10	250895	250904	20 %	20 %	20 %	40 %	222080313
3609	NC_011982	GCGTCA	2	12	250964	250975	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222080313
3610	NC_011982	GCG	2	6	250995	251000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080313
3611	NC_011982	CGA	2	6	251075	251080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080313
3612	NC_011982	TGT	2	6	251081	251086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080313
3613	NC_011982	CGGAT	2	10	251169	251178	20 %	20 %	40 %	20 %	222080313
3614	NC_011982	GCA	2	6	251183	251188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080313
3615	NC_011982	GAC	2	6	251220	251225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080313
3616	NC_011982	GCAC	2	8	251275	251282	25 %	0 %	25 %	50 %	222080313
3617	NC_011982	CG	3	6	251285	251290	0 %	0 %	50 %	50 %	222080313
3618	NC_011982	CTG	2	6	251307	251312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080313
3619	NC_011982	CGA	2	6	251354	251359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080313
3620	NC_011982	GGC	3	9	251454	251462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080313
3621	NC_011982	CGTT	2	8	251485	251492	0 %	50 %	25 %	25 %	222080313
3622	NC_011982	GC	3	6	251502	251507	0 %	0 %	50 %	50 %	222080313
3623	NC_011982	TGG	2	6	251526	251531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080313
3624	NC_011982	CTT	2	6	251564	251569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080314
3625	NC_011982	CGG	2	6	251579	251584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080314
3626	NC_011982	GGC	2	6	251586	251591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080314
3627	NC_011982	CCGGC	2	10	251598	251607	0 %	0 %	40 %	60 %	222080314
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3630	NC_011982	GGC	2	6	251747	251752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080314
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3742	NC_011982	CTG	2	6	256788	256793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080319
3743	NC_011982	GCC	2	6	256818	256823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080319
3744	NC_011982	CGAG	2	8	256856	256863	25 %	0 %	50 %	25 %	222080319
3745	NC_011982	CTGTGA	2	12	256877	256888	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222080319
3746	NC_011982	TCG	2	6	256922	256927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080320
3747	NC_011982	ATGA	2	8	256978	256985	50 %	25 %	25 %	0 %	222080320
3748	NC_011982	GAC	2	6	257026	257031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080320
3749	NC_011982	CCT	2	6	257055	257060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080320
3750	NC_011982	CCG	2	6	257147	257152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080320
3751	NC_011982	CAG	2	6	257176	257181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080320
3752	NC_011982	GCG	2	6	257189	257194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080320
3753	NC_011982	ATG	2	6	257216	257221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080320
3754	NC_011982	GAG	2	6	257251	257256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080320
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3756	NC_011982	CGG	2	6	257322	257327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080320
3757	NC_011982	CGA	2	6	257367	257372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080320
3758	NC_011982	GAT	2	6	257380	257385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080320
3759	NC_011982	CGT	2	6	257398	257403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080320
3760	NC_011982	TCA	2	6	257487	257492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080320
3761	NC_011982	TCG	2	6	257510	257515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080320
3762	NC_011982	CGCC	2	8	257533	257540	0 %	0 %	25 %	75 %	222080320
3763	NC_011982	GCC	2	6	257599	257604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080320
3764	NC_011982	CGG	3	9	257688	257696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080320
3765	NC_011982	CGA	2	6	257778	257783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080320
3766	NC_011982	TCA	2	6	257792	257797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080320
3767	NC_011982	GGC	2	6	257891	257896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080321
3768	NC_011982	GTC	2	6	257901	257906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080321
3769	NC_011982	CGG	2	6	257928	257933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080321
3770	NC_011982	TCGG	2	8	257955	257962	0 %	25 %	50 %	25 %	222080321
3771	NC_011982	CGGCGA	2	12	257975	257986	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222080321
3772	NC_011982	ACG	2	6	258001	258006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080321
3773	NC_011982	GC	3	6	258037	258042	0 %	0 %	50 %	50 %	222080321
3774	NC_011982	CGAAG	2	10	258056	258065	40 %	0 %	40 %	20 %	222080321
3775	NC_011982	TCG	2	6	258085	258090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080321
3776	NC_011982	GAT	2	6	258114	258119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080321
3777	NC_011982	CCT	2	6	258157	258162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080321
3778	NC_011982	CTC	2	6	258166	258171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080321
3779	NC_011982	GTC	2	6	258181	258186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080321
3780	NC_011982	GA	3	6	258231	258236	50 %	0 %	50 %	0 %	222080321
3781	NC_011982	CG	3	6	258301	258306	0 %	0 %	50 %	50 %	222080321
3782	NC_011982	ACC	2	6	258313	258318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080321
3783	NC_011982	TAGG	2	8	258346	258353	25 %	25 %	50 %	0 %	222080321
3784	NC_011982	CGT	2	6	258362	258367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080321
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